Este museo se localiza en la ciudad de Huye, a 132 km al sur de la capital. El Museo Etnográfico, antes Museo Nacional de Ruanda, es uno de los seis museos pertenecientes al Instituto de Museos Nacionales de Ruanda. Su colección es una de las más exquisitas del país y comprende objetos históricos, artísticos y etnográficos que se exhiben a lo largo de las siete salas de exhibición permanente del museo. De este modo, los visitantes adquieren una visión diversificada de la cultura ruandesa y sus ancestros fundadores, los Tutsis, un grupo pastoril. Destacan los múltiples objetos de cestería elaborados por las mujeres de la élite que son un gran ejemplo de los objetos de uso cotidiano con un alto refinamiento estilístico. El lugar donde se ubica este museo tiene una historia trágica para la sociedad ruandesa pues es en este sitio fue asesinada la Reina Dowager en el genocidio de 1994.