Obtuvo su licenciatura en Economía en la Universidad de Burundi en 1986. Se convirtió en profesor en 1987 y finalmente en Director de Finanzas y Administración en la misma universidad. En 1992, obtuvo una Maestría en Economía y en 1996 su doctorado en la Universidad de Washington en St. Louis , EE. UU. Actualmente es Profesor Distinguido de Economía y Director del Programa de Desarrollo de África en el Instituto de Investigación del Instituto de Investigación de Economía Política (PERI) de la Universidad de Massachusetts, Amherst en los Estados Unidos.

Ndikumana está particularmente interesado en la política macroeconómica y en la economía de África. Centra su carrera en las causas de la debilidad de las economías africanas, sus consecuencias y las soluciones necesarias. Es miembro del Comité de Políticas de Desarrollo de las Naciones Unidas. La carrera de Léonce Ndikumana se centra principalmente en el desarrollo de la economía africana, la teoría macroeconómica y el dinero y la banca. Examina el alcance, las causas y los efectos de la fuga de capitales de los países africanos.

Ha recibido distintos honores y premios como el de Profesor honorario de Economía en la Universidad de Stellenbosch en Sudáfrica o en 2018 que recibió la Medalla del Canciller, el premio más alto otorgado por el Canciller a los profesores por becas, entre otros muchos premios.